Struktur sosial Rajabotak sangat hierarkis namun tetap mengedepankan nilai kekeluargaan dan gotong royong. Di puncak struktur terdapat kepala suku atau raja yang memiliki otoritas tertinggi dalam pengambilan keputusan penting. Kepala suku dibantu oleh para tetua adat yang berperan dalam mengatur berbagai aspek kehidupan masyarakat, termasuk perencanaan upacara adat dan penyelesaian konflik. Selain kepala suku, terdapat golongan masyarakat yang memiliki peran khusus, seperti pengrajin.